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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全表观基因遗传基因遗传的组低纵深重测序（Low coverage WGS，LcWGS）指的是使用较低纵深（~1×）的重测序数据源文件报告采用基因遗传的表观基因遗传基因变异临床诊断，完后采用表观基因遗传基因遗传的型粘贴，将低回声结节单位数据源文件报告粘贴为高硬度单位表观基因遗传基因遗传的型数据源文件报告。LcWGS 没有控制系统开发设计，测序投资成本又，还可以提高全表观基因遗传基因遗传的组基因遗传的表观基因遗传基因变异，更影响于大建设规模样板的物理性质固定及 GS 选育应用。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可赚取全显性基因基因组的显性基因遗传变异
  • 高性价比
    以超低的测序成本费用低，取得高硬度的标志，的检测工作高效
  • 大群体
    样本检测
    适用性于大归类的染色体型测量及论述
  • 分型
    准确性高
    由于添加计算方式，分几型最准确度会达98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS物理性质定位系统及GS结杲较好
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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