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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全dna组低深层的重测序(Low coverage WGS,LcWGS)指的是回收利用较低深层的(~1×)的重测序动态数据库库完成隐性染色体染色体基因变异分几型,在这之后确认dna型填色,将低孔隙率动态数据库库填色为高孔隙率dna型动态数据库库。LcWGS 无须系統的开发,测序资金低,都可以想要高效率的获取到全dna组隐性染色体染色体基因变异,更有效于大投资规模样品的物理性质品牌定位及 GS 制种应用软件。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可领取全人类基因组的遗传性突变
  • 高性价比
    以过低的测序的成本费用低,荣获高硬度的标签,在线检测吸收率高
  • 大群体
    样本检测
    适用在于大社会群体的遗传基因型检测工具及深入分析
  • 分型
    准确性高
    基本概念添充汉明距离,临床表现准确无误率能够达到98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS相对性状固定及GS导致相比
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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