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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全人类DNA组低淬硬层重测序(Low coverage WGS,LcWGS)指的是充分利用较低淬硬层(~1×)的重测序数剧库来进行遗传基因DNADNA突变DNA分型,后来在人类DNA型充实,将低容重数剧库充实为高容重人类DNA型数剧库。LcWGS 不需装置搭建,测序制造费低,就能够提取全人类DNA组遗传基因DNADNA突变,更助进于大面积样板的遗传性状分析及 GS 生物育种软件应用。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可赚取全DNA组的显性基因进化
  • 高性价比
    以不高的测序的成本又,获取密度高的计算的标上,查重速率高
  • 大群体
    样本检测
    适于于大行为的遗传基因型查重及科学研究
  • 分型
    准确性高
    系统设计添加法求,临床诊断精准的率会达98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS特性导航定位及GS毕竟十分
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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